La carica di Direttore del Centro è ricoperta di diritto dal Delegato per la disabilità nominato dal Rettore; il suo mandato decade con quello del Rettore e può essere rinnovato. Il Direttore presiede il Comitato Direttivo e la Conferenza dei Referenti.

In collaborazione con il Comitato Direttivo sovrintende e coordina le attività del Centro, curando la realizzazione dei piani programmatici, anche in collegamento con i Responsabili delle Sezioni del Centro.
 
Il Direttore del Centro (Delegato del Rettore per la Disabilità) è il prof. Paolo VALERIO.

Il Comitato Direttivo, nominato dal Rettore, ha tra l'altro il compito di individuare le potenziali esigenze a cui far fronte, sulla base dei dati relativi agli studenti iscritti all'Ateneo per ciascun anno accademico e, a partire da questi, formulare proposte volte a favorire l'inclusione degli studenti.

Il Comitato Direttivo è composto da:

La Conferenza dei Referenti è costituita dai Referenti di Facoltà per l'inclusione attiva e partecipata degli studenti. Ha funzioni consultive e propositive per il Comitato Direttivo.
Si riunisce almeno ogni sei mesi, ed è convocata dal Direttore del Centro.
 
I Referenti di Facoltà per l'inclusione attiva e partecipata degli studenti sono: